На базе НИИЦ проводятся научные исследования, направленные на разработку современной методологии контроля качества и безопасности пищевой продукции, необходимость которых не только не теряет своей актуальности, но постоянно возрастает. Однако не менее важным направлением является постоянный мониторинг этих показателей, который позволяет оценить потребительские характеристики производимой продукции в текущий период, выявить источники происхождения возможных нарушений и их динамику, составить прогнозы на будущее, стимулировать внедрение актуальных методов их контроля и возможной фальсификациии продукции, разработку нормативных документов и отмену устаревших. 

В свете указанных задач была разработана комплексная методика количественного определения крахмала в томатопродуктах с помощью антронового реактива. Эта методика позволяет определять крахмал в присутствии других моно- и дисахаридов и природных красителей с приемлемой для практических задач погрешностью, не превышающей 0,3 %. Был проведен мониторинг количественной доли крахмала в составе томатных кетчупов различных категорий в качестве контроля качественных характеристик данных продуктов. Предложена технология микроскопии клеток гиподермы, паренхимы и зародыша  зеленого горошка для оценки его качества в переработанных продуктах.